Les habitats d'intérêt communautaire peuvent être classés en quatres grandes unités écologiques.
- Habitats humides et aquatiques
- Rivières des étages planitaires à montagnard avec végétation du Ranunculion fluitantis (32 60)
- Prairies à Molinia sur sols toubeux (64 10)
- Mégaphorbiaies gygrophiles d'ourlets planitaires (64 30)
- Habitats forestiers
- Forêts alluviales à Alnus glutinosa et Fraxinus excelsior (91EO)
- Hêtraies acidophiles atlantiques à sous-bois à Ilex et parfois à Taxus (91 20)
- Hêtraies du Asperulo-Fagetum (91 30)
- Forêt de pentes, éboulis ou ravins du Tilio-Acerion (91 80)
- Habitats agro-pastoraux
- Pelouses sèches semi-naturelles et faciès d'embuissonnement sur calcaires (Festuco-Brometalia) (62 10)
- Parcours substeppiques de graminées et annuelles du Thero-Brachypodietea (62 20)
- Formations herbeuses à Nardus, riches en espèces, sur substrats siliceux des zones submontagnardes de l'Europe continentale (62 30)
- Pelouses maigres de fauche de basse altitude (65 10)
- Habitats rocheux
- Landes sèches européennes (40 30)
- Formations à Juniperus communis sur landes ou pelouses calcaires (51 30)
- Pelouses rupicoles calcaires ou basiphiles du Alysso-Sedion albi (61 10)
- Eboulis médio-européens siliceux des régions hautes (81 50)
- Pentes rocheuses avec végétation chasmotphytique (82 10)
- Pentes rocheuses siliceuses avec végétation chasmophytique (82 20)
- Roches siliceuses avec végétation pionnière du Sedo-Acleranthion (82 30)
